(1)宅基地灭失。宅基地是农村宅基地使用权的客体，宅基地因地震、火山喷发、河流改道、山体滑坡等自然灾害的影响，不能恢复原状，不能继续使用或者灭失的，农村宅基地使用权归于消灭。当然如果只是宅基地上的建筑物或其他附属设施灭失的，不影响宅基地使用权的效力。
(2)国家和集体的征收。国家和集体为了公共利益的需要，对农村宅基地进行征收，并改变了该宅基地的用途的，该农村宅基地使用权消灭，任何人不能再取得对该地的农村宅基地使用权。
(二)宅基地使用权的相对消灭
宅基地使用权的相对消灭强调集体经济组织内部某一特定成员丧失了自己的宅基地使用权，但这块农村宅基地的使用权仍客观存在。相对消灭可分为以下四种情况：
(1)因放弃而消灭。国家土地管理局《确定土地所有权与使用权的若干规定》第一百七十一条规定：“宅基地使用权人可以放弃宅基地使用权。放弃宅基地使用权的，宅基地使用权消灭。”
2.农村村民取得宅基地使用权是无偿的，随时可以放弃，但应当事先通知宅基地所有权人，以防止土地资源的浪费。
(2)因转让而消灭。转让宅基地使用权，原来的使用权人就会丧失对该宅基地的使用权。根据《土地管理法》等法规的规定，农村村民在合法转让宅基地使用权之后，不得再申请宅基地。
(3)因撤销而消灭。申请取得宅基地使用权的村民，必须按照规定的用途利用宅基地，擅自改变宅基地的用途，农村集体经济组织有权撤销宅基地使用权，村民从而就会丧失宅基地使用权。
(4)因农村集体经济组织收回宅基地而消灭。根据《土地管理法》和国家土地管理局《确定土地所有权与使用权的若干规定》的规定，为乡(镇)村公共设施和公益事业建设，农村集体经济组织报经县级人民政府批准，有权收回宅基地，而消灭原来设定的宅基地使用权。但是，原来具有宅基地使用权的村民有请求相应损失的补偿的权利。另外，宅基地使用权人因迁移等原因停止使用土地的，农村集体经济组织有权收回宅基地消灭原设定的使用权。
在这些消灭情形中，只有因土地灭失及国家和集体的征收才能导致宅基地使用权的绝对消灭。其他任何情形都不会导致宅基地使用权的绝对消灭。在具体实践中，征收导致宅基地使用权消灭的情形也很多见，但这种使用权消灭的前提是征收程序的合法完成。
3.法律依据：《中华人民共和国土地管理法》第九条 城市市区的土地属于国家所有。
农村和城市郊区的土地，除由法律规定属于国家所有的以外，属于农民集体所有；宅基地和自留地、自留山，属于农民集体所有。
第十条 国有土地和农民集体所有的土地，可以依法确定给单位或者个人使用。使用土地的单位和个人，有保护、管理和合理利用土地的义务。
第十一条 农民集体所有的土地依法属于村农民集体所有的，由村集体经济组织或者村民委员会经营、管理；已经分别属于村内两个以上农村集体经济组织的农民集体所有的，由村内各该农村集体经济组织或者村民小组经营、管理；已经属于乡（镇）农民集体所有的，由乡（镇）农村集体经济组织经营、管理。
第十二条 土地的所有权和使用权的登记，依照有关不动产登记的法律、行政法规执行。
依法登记的土地的所有权和使用权受法律保护，任何单位和个人不得侵犯。
第十三条 农民集体所有和国家所有依法由农民集体使用的耕地、林地、草地，以及其他依法用于农业的土地，采取农村集体经济组织内部的家庭承包方式承包，不宜采取家庭承包方式的荒山、荒沟、荒丘、荒滩等，可以采取招标、拍卖、公开协商等方式承包，从事种植业、林业、畜牧业、渔业生产。家庭承包的耕地的承包期为三十年，草地的承包期为三十年至五十年，林地的承包期为三十年至七十年；耕地承包期届满后再延长三十年，草地、林地承包期届满后依法相应延长。
国家所有依法用于农业的土地可以由单位或者个人承包经营，从事种植业、林业、畜牧业、渔业生产。
发包方和承包方应当依法订立承包合同，约定双方的权利和义务。承包经营土地的单位和个人，有保护和按照承包合同约定的用途合理利用土地的义务。
第十四条 土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。
单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。
当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。
在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。
