1、保密协议书从属于劳动合同，但不是劳动合同的必要条款，而是约定条款。劳动合同的内容可分为两方面，一方面是必备条款的内容，另一方面是协商约定的内容。
2、法律依据：《劳动合同法》第二十三条 用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的事项。
对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。劳动者违反竞业限制约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。
3、单独签的保密协议依然有效
保密协议虽然从属于劳动合同，但可以单独订立，具有法律效力。
劳动合同是用人单位与劳动者确立劳动关系，明确双方的权利与义务的协议。保密协议是当事人之间就一方告知另一方的书面或口头信息，约定不得向任何第三方披露该信息的协议。保密协议虽然从属于劳动关系，但按《劳动合同法》第二十三条、第二十四条之规定，对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款。没有订立劳动合同，只是订立了保密协议的，保密协议有效。保密协议具备劳动合同基本内容的，可以视为劳动合同。