1、单位是可以以员工旷工为由将其开除的。
2、如果员工的旷工行为严重，属于严重违反单位的规章制度的情形的，单位可以与其解除劳动合同，并且不需要给该员工经济补偿金。
3、法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》第三十六条
用人单位与劳动者协商一致，可以解除劳动合同。