企业保护驰名商标的方式：
1、围绕公司商业秘密等相关专业性，开展相应的专业培训，制定相应保护、监督制度；
2、对已经造成侵权的，则企业可以收集认定驰名商标、证明侵权事实的相关证据，请求处理侵权的部门认定驰名商标，予以保护；
3、其他方式。
4、【法律依据】
《中华人民共和国商标法》第十三条
为相关公众所熟知的商标，持有人认为其权利受到侵害时，可以依照本法规定请求驰名商标保护。
就相同或者类似商品申请注册的商标是复制、摹仿或者翻译他人未在中国注册的驰名商标，容易导致混淆的，不予注册并禁止使用。