停工留薪期的确认，各个省市规定不同，大致有以下三种方法：
1、根据治疗工伤医疗机构书面证明，由所在单位按照当地劳动部门《工伤职工停工留薪期》分类目录确定，满一年的以及发生争议的申请劳动能力鉴定委员会确认；
2、根据治疗工伤医疗机构书面证明，由设区的市级劳动能力鉴定委员会确认；
3、根据治疗工伤医疗机构书面证明确认，满一年的以及发生争议的申请劳动能力鉴定委员会确认。
劳动能力鉴定的时机，是停工留薪期满或者伤情相对稳定时，因此，对于采用根据治疗工伤医疗机构书面证明，由设区的市级劳动能力鉴定委员会确认办法的省市，停工留薪期通常是可以与劳动能力鉴定同时进行的；而对于采用其它办法的省市，只有申请延长停工留薪期或者发生争议的，才会申请劳动能力鉴定委员会确认，是不需要一起进行的。
二、法律依据：
《工伤保险条例》第二十一条
职工发生工伤，经治疗伤情相对稳定后存在残疾、影响劳动能力的，应当进行劳动能力鉴定。
