合同与协议在法律上的区别有：
1、性质不同。合同双方的意思都表示一致而达成的一种契约；
2、效力不同。需要公证的协议只是把协议的效力固定并强化；
3、法律效应不同。订立协议书，其目的是为了更好地从制度上乃至法律上，把双方协议所承担的责任固定下来。