宅基地纠纷处理办法有：
1、争议双方自行协商；
2、请求乡级人民政府或者县级以上人民政府处理；
3、对于处理不满意，可以提起行政诉讼。根据《土地管理法》规定，土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。