1、从事自闭症研究的遗传学家凯特，无意中发现智人突变转化要素“亚特兰蒂斯基因”，竟也是1918年杀死全球五千万人超级传染病西班牙流感的始作俑者，却因此遭到神秘千年组织印玛里追缉。

2、在地下反恐探员大卫的协助下，两人发现印玛里掌握人类自古至今的历史进化秘密，与其背后恐怖动机，原本互不信赖的凯特和大卫，必须在有限的时间内携手合作，一起解开这桩危及全世界的跨国阴谋、“亚特兰蒂斯基因”的真相，甚至是人类物种起源之秘……