1、在干燥处常温保存，常温状态下，可直接把百香果放在通风处以便保持干燥环境，但这种方法保存时间仅为一个星期左右。

2、放置于冰箱冷冻保存，用保鲜薄膜将百香果包裹好后放置冰箱中冷冻，即可延长百香果的保存期限，解冻后即可食用，但此法会略微降低口感。

3、制成百香果果酱保存，将百香果洗干净后切开取肉，再加入适量糖将其搅拌均匀，在冰箱中冷藏2小时左右后，取出倒入容器中用中火加热，煮至沸腾后再转小火，整个加热过程中需要不断搅拌。当百香果汁液颜色变深且呈稠状物之后，趁热将制成的果酱装到瓶子里，冷却后放进冰箱封存。此种方法也可实现百香果长时间保存。