毛蚶生活在内湾浅海低潮线下至水深十多米的泥砂底中，尤喜于淡水流出的河口附近，以4-8米居多。
毛蚶幼贝脱离附着基转入潜居生活主要与水温及个体大小有关。当水温降到19℃时,体长≥45mm的幼贝80%开始脱离附着基,转入潜居生活时间是在当年的9月中旬～10月上旬;体长45mm基本不脱离附着基。同种规格的幼贝潜居后比在附着基上生长快36%。幼贝生长最适宜水温是20～26℃,20℃以下生长逐步减慢,到7℃时基本停止生长,停止摄食。
甲肝流行是由于人吃了不洁的毛蚶引发的，这个例子中毛蚶属于传播媒介（生物性传播）。其感染与居住条件、卫生习惯及教育程度密切相关；水源、食物被污染也可呈爆发流行，例如1988年上海甲型肝炎大流行主要由于食用HAV污染的毛蚶引起。
