按法规的要求，员工旷工只是当天不给工资，如果旷工一天扣三天或者500元，属于克扣工资行为，可以申请仲裁。加班支付相应加班费是法律的明文规定，如果公司不支付就是违法行为，可以申请仲裁。

劳动法规定第十二章，法律责任第八十九条：用人单位制定的劳动规章制度违反法律、法规规定的，由劳动行政部门给予警告，责令改正;对劳动者造成损害的，应当承担赔偿责任。

第九十条：用人单位违反本法规定，延长劳动者工作时间的，由劳动行政部门给予警告，责令改正，并可以处以罚款。