1、留守儿童的基本权利得不到保障，祖父母等亲属或因年长，或因经济生活等多种原因无法认真行使对儿童的监护权的情况随时可见，儿童在健康、教育、文化娱乐等方面的权益受到侵犯的事件屡有发生，前段时间在一些农村发现的毒奶粉事件和前不久河南系列杀人案件的受害者中，留守少年儿童占到相当比例。

2、思想道德教育上的缺失，留守的少年儿童正处于成长发育的关键时期，他们无法享受到父母在思想认识及价值观念上的引导和帮助，成长中缺少了父母情感上的关怀和呵护，极易产生认识、价值观上的偏离和个性、心理发展的异常，使得他们形成了不良的个性特征和行为缺陷，集中表现为：任性、冷漠、自卑、郁闷、失望、敏感、孤独、不安、胆怯、自我封闭和是非感模糊等，很多儿童由于无人管理或管理不当而与社会上的不法分子混在一起，养成了不良的行为习惯，甚至走上了违法犯罪的道路。

3、家庭教育环境的缺失，一方面，农村贫困家庭不能为儿童的教育提供良好的学习条件；另一方面，大部分留守儿童在家还要承担大量的家务和农活，尤其是父母一方在家或者孩子一个人留在家时，情况更是如此，由于留守儿童的监护人大都是爷爷奶奶或外公外婆，他们的文化素质普遍偏低，无能力辅导儿童的学习，其家庭也缺少文化氛围，从而造成留守儿童的受教育环境较差的局面，另外，父母的长期打工生涯给孩子们造成了一种读不读书都一样的思想，如有的父母认为孩子上不了学不要紧，今后跟爸妈一起外出打工挣钱，这种思想潜移默化，极易助长一些成绩不好的学生产生读书无用论的思想。