矿泉水中含有微生物，但是对人体无害。微生物无处不在，但不是所有都对人体都有害。人的肠道中有许多微生物是帮助人体消化的。微生物包括：细菌、真菌以及一些小型的原生生物、显微藻类等一大类生物群体以及病毒，个体微小、种类繁多，与人类关系密切。涵盖有益跟有害的众多种类，广泛涉及食品、医药、工农业、环保等诸多领域。