1、酿造原料不同：酿造醋多以糯米、玉米、小麦以及糖类、酒类为酿造原料。酿造酒则多以高粱、玉米、大麦、小麦、大米、豌豆这些淀粉含量高的食物为原料。

2、曲种不同：酿造醋的曲种主要是以根霉为主的白色曲、以米曲霉为主的黄色曲两类。酿造酒则使用米曲霉、黑曲霉、黄曲霉等。

3、发酵菌种不同：酿造醋采用的是酸醋菌种，会进行固体分层发酵。酿造酒则采用酵母菌使葡萄糖发酵产生酒精。