外地就医的农村合作医疗在参合地医保申请批准后可以报销。在外地住院就医时，需要先向参合地医保提出申请，批准了以后可以报销，否则参合地是不给报销的。参保地批准以后带上住院的病历、住院的发票、费用清单、疾病诊断书、出院的小结、身份证、户口本和合作医疗本及转院的手续这些资料到指定的报销医院的医保结算窗口进行报销。

法律依据：

《中华人民共和国社会保险法》第二十三条的规定，不支付工伤、第三方侵权造成的意外伤害医疗费用，因为本人意愿或者不可抗力因素造成的意外伤害的治疗费用，按照疾病医疗相同的报销比例报销。