1、形状不同：瓜蒌子为扁平椭圆形，种皮坚硬，内种皮膜质，沟纹明显而环边较宽，顶端平截；吊瓜子果实椭圆形或圆形。

2、颜色不同：瓜蒌子表面为棕褐色；吊瓜子表面黄褐色或橙黄色。

3、营养不同：瓜蒌子含有丰富蛋白质，以及大量不饱和脂肪酸；吊瓜子含有多种矿物质和维生素、微量元素硒和维生素E。