蝙蝠是胎生动物。蝙蝠每年繁殖一次，通常每窝产1至4仔，幼仔初生时无毛或少毛，常在一段时间内不能视不能听，由亲体照顾5周至5个月。蝙蝠常集群生活，整个蝙蝠群的性周期是同步的，因此大部分交配活动发生于数周之内，妊娠期因种类不同而略有差别。