鸟氨酸不是天然氨基酸。化学式为C5H12N2O2，是一种碱性氨基酸。鸟氨酸不属于组成蛋白质的20种氨基酸，在天然蛋白质中不能找到，只存在于短杆菌酪肽、短杆菌肽S等的抗菌性肽中。另外从深山紫堇根中发现了δ-N-乙酰鸟氨酸，是由精氨酸为碱或精氨酸酶作用分解生成。