三江源地区环境恶化的原因是有人为破坏以及自然原因。人为破坏的行为主要是挖虫草、过度放牧，导致沙漠化的进程加快，水土流失严重，使环境恶化，影响其余生物的生存。自然原因有全球气候变暖，温室效应导致雪线后退，以及三江源地区的气候干旱，易造成沙漠化。