公司员工出差发生了住宿费，酒店费给开具了增值税专用发票，可以抵扣。住宿费为员工出差，开票方为小规模纳税人，其增值税用发票抵扣率为3%；住宿费为员工出差，开票方为一般纳税人，其增值税用发票抵扣率为6%。