公司营业执照不注销的后果是税务会被永久纳入监控黑名单，个人信用记录会被记录进征信系统，不在规定的时间内注销的企业将被拉入工商部门黑名单。根据《公司法》第一百八十八条规定，公司清算结束后，清算组应当制作清算报告，报股东会、股东大会或者人民法院确认，并报送公司登记机关，申请注销公司登记，公告公司终止。