西红柿秧苗发黑可能是晚疫病引起的。发病初期可以选用58%甲霜·锰锌可湿性粉剂400-500倍溶液、70%代森锰锌可湿性粉剂500倍溶液、72%霜霉疫净可湿性粉剂800-1000倍溶液喷施防治西红柿晚疫病，连续喷药2-3次，间隔7-10天喷1次。