两种病毒感染靶细胞相同
高致病性猪蓝耳病病毒和猪瘟病毒感染的靶细胞主要是：肺泡巨噬细胞(PAM)，血液中单核细胞和的淋巴细胞等，这些细胞是免疫系统的重要组成部分，受到侵害后，猪体免疫系统遭到破坏，因此这两个病均是免疫抑制病。
两种疾病临床症状相同
急性猪瘟的发病特征：潜伏期短1-2天即发病，10-20天死亡，死亡率高。临床症状：精神沉郁、高热、厌食、结膜炎、便秘、下痢、痉挛、运动失调，皮肤发绀。
而且有高水平的病毒血症，以上特征与高致病性猪蓝耳病完全相同，这也是2006年“高热病”发生时，现地很多人把一开始把“高热病”当做急性猪瘟的主要原因。
目前我国现地单纯从流行病学、临床症状和病理剖检来区分高致病性猪蓝耳病和猪瘟是有困难的，养猪者对猪瘟的重视程度（疫苗选择、免疫密度）远大于对高致病性猪蓝耳病的重视，但猪群发生问题，从临床上症状上诊断后往往还按猪瘟处理，忽视了高致病性猪蓝耳病，这些年很多猪场的高致病性猪蓝耳病被错误的诊断为猪瘟，由于弄错了防治方向使问题得不到解决。
另外，猪群发生猪瘟临床症状，并在猪群中检出猪瘟病毒，可以确诊为有猪瘟，但造成这次猪瘟免疫失败的原因不能单纯认为是猪瘟疫苗免疫效果不好，很可能是猪群感染高致病性猪蓝耳病病毒使免疫系统遭到破坏而造成的猪瘟疫苗免疫失败，并导致猪瘟发生。
因此有必要重新认识猪瘟与高致病性猪蓝耳病的关系，当猪场发生类似猪瘟疫情时，应同时做高致病性猪蓝耳病和猪瘟的病原学检查。如果情况紧急，建议选取部分健康猪群做两种疫病的紧急处理，对比一下控制效果，进而明确本次疫情的来源。
