有机水果和绿色水果的区别是：有机水果跟种植过程有关，是通过有机农业生产出来的水果。绿色水果是指无污染的安全、优质、营养类水果。

有机水果完全不用化学肥料、农药、生长调节剂、蓄禽饲料添加剂等合成物质，也不使用基因工程生物及其产物。绿色分两种，A级和AA级。前者允许限量使用化学合成生产资料，后者则较为严格地要求在生产过程中不使用化学合成的肥料、农药、兽药、饲料添加剂、食品添加剂和其他有害于环境和健康的物质。AA级绿色水果基本等同于有机水果。有机水果比绿色水果难得。

有机水果在可能的范围内，尽量依靠轮作、作物秸杆、家畜粪尿、绿肥、外来的有机废弃物、机械中耕、含有无机养分的矿石及生物防治等方法，保持土壤的肥力和易耕性，供给作物养分，防治病虫杂草危害。