1、科属区别：土茯苓是多孔菌科真菌茯苓的干燥菌核，茯苓是百合科植物攀援植物光叶菝葜的干燥根茎。2、药性区别：土茯苓主要在于“解毒”二字，茯苓主要在于“宁神”二字。3、功效区别：土茯苓有解毒、除湿、通利关节等功效，茯苓有利水渗湿、健脾、宁心等功效。

一、科属区别

1、土茯苓：是一种多孔菌科真菌茯苓的干燥菌核，虽一字之差，但没有任何关系。

2、茯苓：是一种百合科植物攀援植物光叶菝葜的干燥根茎，在中医学上属于两种不同的药材。

二、药性区别

1、土茯苓：主要可以用来解毒，如饮食不当，或者由于感染，皮肤出现了是真等，就可以用土茯苓进行解毒。

2、茯苓：主要可以用来宁神，如遇春困或是长时间疲劳等，还有失眠，就可以用茯苓调理。

三、功效区别

1、土茯苓

（1）可以解毒、除湿、通利关节等，主要对梅毒及汞中毒、筋骨疼痛、带下、痈肿、瘰疬、疥癣等症有效。

（2）同时内服还有促进睡眠、延年健智的作用，或者内服能祛斑美容，外用可以作为面膜使用。

2、茯苓

（1）可以利水渗湿、健脾、宁心等，主要对水肿尿少、痰饮眩悸、脾虚食少、便溏泄泻、心神不安等有效。

（2）对身体的水肿和小便困难有很好疗效，还含有丰富的抗癌物质，还有养心安神以及治疗咳嗽的作用。