诊断鱼病最好是先作现场调查，了解病鱼在池中的各种表现，了解饲养状况，凋查发病情况和发病史及环境条件，然后再针对每个个体进行肉眼检查、镜检以至水质化验。

(1)肉眼检查：肉眼检查是最常用的简便方法，但必须掌握好各种病症的特征症状。材料必须是没死或刚死的鱼，检查部位由表及体。

①看体表：体表有白色丛生毛状物，在水中呈灰白棉花状多为水霉病，少数可能是纤毛虫类的钟虫、聚缩虫等（多为甲壳动物）。鱼尾柄发白病变部位向腹、胸部蔓延多为自皮病，鱼眼混浊、白内障，严重时晶体膜脱落可能为复口吸虫病：肛门红肿，轻压腹部有黄色粘液从肠道流出则可能为细菌性肠炎。夏花鱼种头部和嘴周围色素消失，呈白头白嘴（在水中更明显），多为白头白嘴病，在尾柄及腹部两侧形成近圆形红色病灶多为打印病，对一些肉眼可见的病原生物，如锚头蚤，在鱼体表、鳃、口腔等处可见针状虫体：红线虫，在鳍的间膜中可见红色虫体，蚂蟥寄生则可见蚂蟥。鱼鲺等肉眼可见鱼体表有鱼鲺附着。

②看鳃：首先看鳃盖内表皮有没有腐烂或变成透明现象，如有，并且打开鳃盖发现鳃丝末端有腐烂现象多为细菌性烂鳃；如果没有，则看上面有无寄生虫，如无寄生虫，而鳃比正常鱼的鳃片颜色较白，略带小红点则可疑为鳃霉病。鳃上有寄生虫寄生，则鳃盖张开，鳃丝肿大。寄生虫为白色胞囊者可疑为粘孢子虫病，白色蛆状物多为中华鳋，如鳃上粘液较多则寄生虫有车轮虫、隐鞭虫、斜管虫、鱼波豆虫、指环虫等。

⑧看内脏：剖开腹部看内脏有无腹水，有腹水，而体表伴有出血症状，多为细菌感染：无腹水，观察肝脏有无病变，如脂肪肝等。然后看胚内是否有寄生虫，如鱼怪、线虫、绦虫等。再观察肠壁充血发炎现象，肠弹性差又充血发炎，肛门红肿，多为细菌性肠炎；剪开肠，肠壁内有成片或稀散小白点为球虫、粘孢子虫、对线虫、棘头虫等，芝麻状的小虫可疑为侧殖吸虫。

(2)用显微镜检查和水质化验：对于一些肉眼难以分辨的症状，病原则需作进一步分析，在显微镜下观察是否有可见病原生物，或进行病理切片观察，必要时作一些水质化验，检查水体有无重金属污染、农药污染等。