山茱萸别称山萸肉、山芋肉、山于肉等，为落叶乔木或灌木，高4-10米，树皮灰褐色，小枝细圆柱形，无毛或稀被贴生短柔毛冬芽顶生及腋生，卵形至披针形，被黄褐色短柔毛。

山茱萸叶对生，纸质，卵状披针形或卵状椭圆形，长5.5-10厘米，宽2.5-4.5厘米，先端渐尖，基部宽楔形或近于圆形，全缘，上面绿色，无毛，下面浅绿色，稀被白色贴生短柔毛，脉腋密生淡褐色丛毛，中脉在上面明显，下面凸起，近于无毛，侧脉6-7对，弓形内弯，叶柄细圆柱形，长0.6-1.2厘米，上面有浅沟，下面圆形，稍被贴生疏柔毛。

山茱萸为伞形花序生于枝侧，有总苞片4，卵形，厚纸质至革质，长约8毫米，带紫色，两侧略被短柔毛，开花后脱落，总花梗粗壮，长约2毫米，微被灰色短柔毛;花小，两性，先叶开放，花萼裂片4，阔三角形，与花盘等长或稍长，长约0.6毫米，无毛，花瓣4，舌状披针形，长3.3毫米，黄色，向外反卷，雄蕊4，与花瓣互生，长1.8毫米，花丝钻形，花药椭圆形，2室，花盘垫状，无毛，子房下位，花托倒卵形，长约1毫米，密被贴生疏柔毛，花柱圆柱形，长1.5毫米，柱头截形，花梗纤细，长0.5-1厘米，密被疏柔毛。

山茱萸的核果长椭圆形，长1.2-1.7厘米，直径5-7毫米，红色至紫红色，核骨质，狭椭圆形，长约12毫米，有几条不整齐的肋纹。花期3-4月，果期9-10月。