选种与选育是提高种鸵鸟品质、增加良种数量及改进鸵鸟产品质量与扩大优质产品额的重要工作。选择的作用在于能定向地改变种群的基因频率，从而改变生物类型。而基因频率的定向改变，归根结底是由于打破了繁殖的随机性和群体基因频率的平衡状态，以达到改变种群中质量性状各种类型的比率和数量性状的全群平均水平。

（一）成鸟的选择

作为种鸵鸟必须有优秀的生产性能而没有遗传缺陷。因此，除参考系谱外（但有些场的系谱有时不全）主要是通过外貌特征和生产性能加以选择。

1．根据外貌特征进行选择

总体要求是外貌结构良好，体大健壮，生长发育正常，性情温顺，活泼好动。具体要求：母鸵鸟头细清秀，眼大有神、颈粗细适中，不弯曲。体躯长宽而深，呈椭圆形，腰脊微龟背形，不弯曲，不过肥，也不过瘦。羽毛光洁而润泽，覆盖均匀。肢形正常，长短适中，强壮有力。公鸵鸟要求头较大，眼大有神，颈粗长，体躯前高后低，有雄像，腿前后均红，喙红，眼圈红，泄殖腔周围红，生殖器大而红。

2．根据生产性能进行选择

优秀的母鸵鸟一般隔一天产一枚蛋，连产20多枚休息6-12天，一般4岁以上的母鸵鸟，年产蛋应在80枚以上且无生殖道疾病，所产蛋的表面光滑，蛋形正常。优秀的公鸵鸟配种次数多，一般日配超过6次，这种雄鸵鸟性欲旺盛，种蛋的受精率高，没有遗传缺陷。

（二）幼鸵鸟的选择

根据幼鸵鸟的系谱和生长发育情况加以选择，选择系谱清晰，近交系数低，母鸟产蛋性能高，种蛋受精率高，幼鸟自身生长速度快，发育好，外貌特征符合品种要求，无畸形无缺陷者。

外地选购小鸵鸟时，更应严格考查近交程度，避免造成近交退化现象。最好从二个场选购小鸵鸟，可有效地避免近亲交配。由于母鸵鸟的性成熟时间比公鸵鸟早半年至一年，因此，选购或组群时一般要求公鸵鸟的年龄比母鸵鸟的年龄大6--10个月。