1、万寿菊经常会有斑枯病，这种病害是由真菌中引起的，在高温多雨的闷湿天气容易发病。发病时叶片出现斑点，并会扩大增多，严重时叶片变黄，发黑变干枯，最后脱落。防治方法，在日常管理中要保持通风，做好水肥管理。发病时摘除病叶，还可喷50%托布津1000倍液或多菌灵800倍液治疗，还可以喷洒10%波尔多液，每隔10天喷洒1次，连续3～4次，可控制病害。

2、立枯病主要发生在万寿菊的育苗期，发病时万寿菊茎基部会产生椭圆形褐色小斑点，病斑逐渐扩大，使茎部干枯，幼苗死亡。防治方法，万寿菊爆发立枯病时，可以用50%多菌灵或50%代森锰锌1000倍液喷洒治疗，7～10天喷洒1次。

3、万寿菊爆发白粉病时，一般是在湿度大，光线不足，通风条件差的情况下容易感染此病。发病时，万寿菊的叶、茎、枝和花蕾上会长出白粉，叶片枯萎，不开花。防治方法，万寿菊爆发白粉病时，要求保证生长环境通风，空气湿度相对较小。在万寿菊的生长期间可用甲基50%托布津800～1000倍液或二硝散200倍液喷雾防治。