1、首先控制蚜虫传毒，辣椒病毒病主要靠蚜虫传播，因此要彻底防治蚜虫。据蚜虫的特点，应在蚜虫初发阶段及时用药，如25%敌杀死乳剂、30%速灭杀丁乳剂等，或采用银灰薄膜避蚜，也可覆盖防虫网防蚜。

2、药剂防治辣椒病毒，病发病前用1.5%植病灵乳剂1000倍液、20%病毒A可湿性粉剂500倍液和菌毒克每隔7～10天喷1次，能很好地预防辣椒病毒病的发生。辣椒病毒病发病初期，用菌毒清和黄腐酸盐灌根并喷施，每7～10天1次，连施2～3次，防效很好。在重病区可适当增加喷施浓度。