1、引致水箱的水回流。蓝泡泡洁厕灵的使用方法是丢入马桶水箱内，通过抽水进行马桶清洗的。但是有部分住在高层的家庭偶尔会发生水压不足的现象，水压低时，厕所马桶的蓝色水就会向管道内倒灌，从而导致水龙头的水都是蓝色。蓝泡泡引致水箱的水回流，给生活用水造成不便，是危害之一。

2、具有刺激性气味。蓝泡泡洁厕灵是一款清洁用品。市面上的洁厕灵主要成分有盐酸，盐酸是一种具有强烈刺激性气味的物质，就算稀释到5-10%的稀溶液，也容易挥发到空气中。加上人体吸入过量盐酸，会损伤呼吸器官，这也是蓝泡泡洁厕灵的危害之一。

3、缩短马桶使用寿命。蓝泡泡洁厕宝的成分多为无机酸、有机酸、缓蚀剂、增稠剂、表面活性剂等。洁厕宝中的酸性物质容易腐蚀马桶水箱组件，缩短马桶使用寿命。同时还会造成水源污染，影响环境。