反相柱没有酸碱性区分，因为正极和负极的氧化物不同，但是可以通过颜色区分。其中酸性柱一般为蓝绿色，碱性柱一般为红褐色。反相柱填料是非极性的，官能团为烷烃，例如：C18(ODS)、C8、C4等。