1、一说是跟祭大禹有关，当年大禹用疏导之法，使三江通流入海，太湖水位下降，水患得以平息，为种植冬小麦创造了条件，深得苏州人的爱戴。清明节时正是冬小麦返青的时候，把糯米粉染成青色，以示不忘大禹治水之恩。

2、一说是和李秀成有关。传说有一年清明节，太平天国李秀成得力大将陈太平被清兵追捕，附近一位农民将陈太平化装成农民模样，与自己一起耕地。没有抓到陈太平，清兵在村里添兵设岗，检查每一个出村的人，防止他们给陈太平带吃的东西。回家后，这位农民思索带什么东西给陈太平吃时，一脚踩在一丛艾草上，滑了一跤，爬起来时手上、膝盖上都染上了绿莹莹的颜色。他连忙采了些艾草回家洗净煮烂挤汁，揉进糯米粉做成米团子，然后把青团子放在青草里，混过村口的哨兵。陈太平吃了青团，觉得又香又糯且不粘牙。天黑后，他绕过清兵哨卡安全返回大本营。后来，李秀成下令太平军都要学会做青团以御敌自保。吃青团的习俗就此流传开来。