根系是甜瓜吸收养分、水分的重要器官，也是有机合成的重要场所。露地及保护地不吊蔓栽培形式的甜瓜，打叉的时候建议使用三蔓整枝法或是四蔓整枝法。

三蔓整枝适用于露地及保护地不吊蔓栽培形式。主要方法是：主茎三叶一心至四叶一心时掐尖，每株留三根结实的种子藤蔓。第一个子蔓可以在第三片叶子上留下甜瓜，第二个子蔓藤可以在第二片叶子上离开甜瓜，第三主蔓藤可以在第一片叶子上离开甜瓜。

每个子蔓上留3~4个孙蔓，每枝留3片叶，全株留3个瓜。果实的成熟和销售较为集中。全株有50多片叶，平均每瓜有17-20片功能叶，保证了叶的光合产物满足膨大瓜和糖分积累的要求，促进了果实的正常生长发育。

四蔓整枝适用于露地及保护地不吊蔓栽培形式，方法是：主茎四叶一心至五叶一心时掐尖，每株留四条健壮子蔓，第一分枝在第四叶可以留1个瓜，第二分枝蔓藤可以在第三叶离开瓜，第三主蔓可以在第二叶离开瓜，第四分枝藤可以在第一叶离开瓜。每枝留3-4株葡萄藤，每枝留3片叶摘心，全株留4个瓜。