1、这是一个未来的科幻故事，主角不是阿泰尔 ，是一个叫戴斯蒙德·迈尔斯的酒吧服务生，阿泰尔是他的祖先，邪恶的Abstergo试图把他在基因里关于阿泰尔的记忆提取出来（目的是寻找古代神器的下落），最关键的一段记忆无法提取，说是被Desmond的潜意识挡住，所以只能让他回想之前和之后的事刺激他想起那段记忆，因此游戏都是Desmond的梦境，或者说是关于以前他祖先阿泰尔的记忆。
2、古代圣堂骑士和刺客部落的争斗一直延续至今，戴斯蒙德·迈尔斯作为刺客后代一员被Abstergo公司绑架后逼迫其回忆祖先的记忆（此公司由圣堂骑士的后代组成，为达目的却不择手段；他们试图通过控制人类 的意识和杀掉那些不被他们能力影响的人，让世界得到和平。），公司的目的是找到一种叫伊甸园碎片的神器，并试图查出其它几个碎片的位置，这种神器有很多个，记忆中阿泰尔的师父Mualim在游戏一开始得到的那个东西就是其中之一，这种神器的力量是给人幻觉 （精神控制，统治世界的关键手段），公司的原计划是试用利用主角来找寻和取得那些远古神物。然后它们发射到太空中，在低轨道上运行并替所有人洗脑。
3、但阿泰尔和戴斯蒙德·迈尔斯作为刺客部族有一种特殊的能力，就是看穿一切幻觉和谎言，所以整个游戏Mualim在控制阿泰尔的时候困难重重，阿泰尔也几次在任务中质疑任务本身，最终阿泰尔自己悟出（不是完全自己悟出，有一些人的帮助）真相，游戏终章和Mualim决斗，Mualim再次试图用神器控制阿泰尔，结果还是没有鹰之视野强大，最终失败。
