空调有异味的关键原因是空调有霉菌生长的三个条件(即温暖、湿度、营养源)。所以这些顽固的杂质停留久了之后，汽车的蒸发箱就会成为细菌和霉菌的生长地。因此，每次打开空调，这些细菌和霉菌就会随着空调风进入车内，被吸入人体，导致头痛、发烧、突然喉咙痛、扁桃体感染、哮喘、流感症状、皮炎和伤口。

一般来说，汽车空调开了不是空调系统的问题，而是加热/冷却系统的风道有异物或者不干净。比如空调系统转动时，空气中的水蒸气在空调的冷凝器蒸发器表面发展变化形成冷凝水，空调关闭后一部分水会留在蒸发器和空调管路中。这些水与空气中的微生物和污染物结合在一起。在潮湿、温暖、黑暗的空调系统中，成为霉菌滋生的温床，或者司机、乘客在车内吸烟产生的尼古丁，以及车内橡胶、塑料、皮革的气味和外界空气中的烟尘、废气进入车内，污染空调系统。