公积金是可以对冲商贷的。

个人在单位按时缴纳公积金，没有使用公积金办理公积金购房贷款，购买住房时使用了商业贷款的话，可以携带商业购房贷款合同、购房合同前往当地的住房公积金管理中心，申请提取公积金账户余额来冲抵商业贷款，按要求填写申请表格，审核通过后，公积金管理中心会将公积金提取额汇入个人名下的公积金卡中。