《财政部税务总局关于调整增值税税率的通知》规定，农业生产企业销售自产的农产品免征增值税，但从农业生产企业购买农产品取得农产品销售发票可以抵扣进项税额。

苗木属于《财政部国家税务总局关于全面推开营业税改征增值税试点的通知》（财税[2016]36号）规定的建筑服务中的“其他建筑服务”，适用9%的增值税税率，从农业生产企业购买的苗木按9%的扣除率抵扣进项税额。