水利建设基金申报时计税依据是营业收入、水利建设基金是专项用于水利建设的政府性基金，对于企业来说，计入到税金及附加科目进行核算。企业在月末或者季度末的时候进行计提，下个月或者下个季度进行缴纳，其分录为，

借：税金及附加，

贷：应交税费—应交水利建设基金，

缴纳时，

借：应交税费—应交水利建设基金，

贷：银行存款。