一般来说，用户是不可以通过ATM机进行现金跨行存款的，只能通过ATM机进行跨行转账或者跨行取款。用户在通过ATM机进行跨行转账的时候是会收手续费的，不同的银行对于手续费的收取标准也会也有所差异。通常，跨行转账的手续费在转账金额的1%左右。