乳酸菌在水产养殖的作用较多，可以分解蛋白质，但不产生腐败产物，更容易使水产吸收，缓解生物体内弧菌死亡释放的毒性，保护水产的肝脏，增强解毒、排毒功能，也可以有助于钙、铁、维生素的吸收，加强水产的免疫力和抗病能力，还可以改善水质。乳酸菌可在给水产喂食时使用，与饲料拌匀后一起投喂。