1、污染环境：大苍蝇的个体很大，身体内部的组织物更多，如果用苍蝇拍拍死了大苍蝇就会让苍蝇体内的各种组织物溢出，污染很大一片地方，所以建议使用杀虫剂处理大苍蝇。

2、带有病毒：苍蝇的身体里有虫卵，特别是大苍蝇，身体里的虫卵更多，如果打死了大苍蝇就会让虫卵掉出来，且苍蝇携带众多病毒，打死后如果不处理干净，会导致病毒传播。

3、进化弊端：苍蝇的个体很小，是苍蝇可以到处传播繁殖的有利条件，但是大苍蝇很容易被打死，这是因为大苍蝇个体太大，行动缓慢，有一种科学说法是让苍蝇体型变大后就更容易被自然界的其他生物消灭，所以保留大苍蝇会让苍蝇演化的体型慢慢变大，这样更容易消灭苍蝇这个种群。